Der Plasmid-Maker Stapel

Der "Plasmid-Maker" dient als Datenbank für Gene und Plasmide, als computerisiertes Genlabor und zum Zeichnen von Plasmidkarten.
Leider reichen meine Programmierkünste nicht soweit, daß die Karten im Programm selbst zu sehen sind; erzeugt werden nur Postscript-Beschreibungen, die in Adobe Illustrator nachbearbeitet werden können und sollten. Wer den teuren Illustrator nicht besitzt, kann die Postscriptdatei mit dem Shareware-Konverter EPStoPICT in eine editierbare PICT-Datei umwandeln.

Jedes Plasmid steht auf einer separaten Karte mit

Abbildung: englische Version im Modus "Gen eingeben"

Die Listen lassen sich mit "Verschönern" nach der Position/Anfangsposition sortieren und mit Leerzeichen ausrichten (ist nach "Klonierungen" nötig).
"Sortieren" ordnet alle Plasmide der Sammlung alphabetisch.

Die unterschiedlichen Funktionen des Stapels werden am Rollmenu "Aktion" gewählt.

Probleme, Schwächen, Einschränkungen:

Wenn die Sammlung wächst, wird das hierarchischen Klappmenu mit den Plasmidnamen unangenehm groß. Abhilfe könnte eine weitere Unterteilung in Sub-submenus sein (vielleicht in einer zukünftigen Version). Derzeit ist es bei großen Datenmengen am besten, die Plasmide auf mehrere Sammlungen zu verteilen. Dazu ist das Ex- und Importieren sehr nützlich.
Das Programm hat keine Suchfunktion (aber Hypercards "Finden..." funktioniert). Mit meiner Plasmid- und Stammdatenbank "Plasmidsammlung" (ebenfalls Hypercard, ebenfalls Freeware, ebenfalls auf diesem Server) sind komplexere Suchen (An-/Abwesenheit von Genen, Suche nach Stammname, freie Textsuche) möglich.
Das Erstellen von Plasmidkarten wäre natürlich viel einfacher, wenn das Programm sie darstellen und die Elemente im Plasmid-Maker selbst bearbeitet werden könnten, oder wenn beim Erstellen der Postscriptdatei ein Überlappen von Texten vermieden würde. Das alles übersteigt leider meine Möglichkeiten beim Programmieren.

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Last edited: December 1, 1999 by KaiFr